Датой зарождения научного коллектива НПО «Тайфун» правомерно считается 1 июля 1958 г. А реальные шаги для этого зарождения начались в январе 1956 г., когда был образован в Москве в составе Академии наук СССР Институт прикладной геофизики (ИПГ). Организовал и возглавил его член-корр. АН СССР Е. К. Федоров.
После ввода в эксплуатацию аэрозольного корпуса в Филиале появилась возможность решать следующие задачи:
В то же время руководством Главного управления гидрометеорологической службы (ГУГМС) было принято решение об организации ракетных экспериментов с помощью метеорологического ракетного комплекса МР-12 в средних широтах (на полигоне Министерства обороны Капустин Яр) и в высоких широтах (остров Хейса, архипелаг Земля Франца-Иосифа). В 1964-1967 г г. были проведены успешные научные эксперименты при 78 пусках ракет комплекса МР-12 на полигонах МО, на о. Хейса, на ведомственной станции ракетного зондирования атмосферы — СРЗА М-202. В этих экспериментах сотрудники Филиала получили ценные научные результаты по физике верхней атмосферы. Успешные результаты внедрения ракетного метеорологического комплекса МР-12 для проведения исследований верхней атмосферы и околоземного космического пространства позволили использовать его в работах по международному научно-техническому сотрудничеству СССР с рядом зарубежных стран. Правительство СССР определило Гидрометеослужбу головным ведомством в стране, ответственным за сотрудничество в области космической метеорологии. В октябре 1967 г. на о. Хейса был проведен первый в СССР пуск ракеты с советско-французской научной аппаратурой. Этот пуск был первым международным ракетным экспериментом не только для ученых Гидрометеослужбы, но и для ученых СССР. Всего в 1968-1969 г г. на СРЗА М-202, на о. Хейса и с борта НИС Институт экспериментальной метеорологии произвел 125 успешных пусков исследовательских метеорологических ракет, в которых ученые Гидрометеослужбы и других ведомств провели 217 успешных научных экспериментов.
Успешно развивались в Обнинске работы по радиационной геофизике. Также ежегодно организовывались полугодовые сухопутные маршрутные экспедиции. Расширились работы летных экспедиций по изучению стратосферного аэрозоля.
В 1968 г. на базе Обнинского филиала ИПГ был организован Институт экспериментальной метеорологии (ИЭМ).
С 1969 г. на ИЭМ были возложены функции центрального органа, осуществляющего государственный надзор за радиоактивным загрязнением континентального шельфа СССР.
С 1973 г. на ИЭМ были возложены обязанности головного учреждения по изучению химического загрязнения почв на территории СССР.
К середине 1985 г. ИЭМ стал одним из крупнейших научно-исследовательских учреждений Гидрометеослужбы страны. В институте работало 17 научно-исследовательских подразделений:
Последние три отдела были объединены в оперативный центр прецизионных измерений (ОЦПИ).
В 1986 г. было создано научно-производственное объединение «Тайфун» (НПО «Тайфун»). Объединение было образовано на базе Института экспериментальной метеорологии и части подразделений Центрального конструкторского бюро гидрометеорологического приборостроения (ЦКБ ГМП).
Генеральным директором объединения был назначен В. П. Тесленко (1986-1990 г г.), затем — доктор физико-математических наук О. А. Волковицкий (1990-1996 г г.), затем — кандидат физико-математических наук А. Д. Орлянский (1996-2006 г г.), затем — доктор технических наук В. М. Шершаков (2006 г. — по настоящее время).
Структурными подразделениями НПО «Тайфун» являлись:
26 апреля 1986 г. произошла катастрофа на Чернобыльской АЭС. Решением директивных органов общая координация работ по контролю, оценке и прогнозу радиационной обстановки в связи с аварией на ЧАЭС была возложена на Председателя Госкомгидромета СССР Ю. А. Израэля. С 30 апреля 1986 г. функции головной организации по сбору информации, анализу поступающих проб, оценке радиационной обстановки и по подготовке прогнозов были возложены на ИЭМ. Всего в апреле-мае 1986 г. в работах в районе аварии принимали участие 34 специалиста ИЭМ. На базе подразделений Информационно-вычислительного центра (ИВЦ), с участием научных отделов ИЭМ в 1994 г. был создан Центр по представлению оперативной и прогностической информации об аварийной радиационной обстановке на территории Российской Федерации (ОЦ НПО «Тайфун», начальник, кандидат технических наук В. М. Шершаков). В июле 1997 г. ОЦ НПО «Тайфун» был переименован в Федеральный информационно-аналитический центр Росгидромета (ФИАЦ Росгидромета) по обеспечению оперативной и прогностической информацией в чрезвычайных ситуациях, связанных с аварийным загрязнением окружающей среды на территории Российской Федерации.
В 1987 г. диоксин был внесен в перечень специфических ингредиентов, подлежащих контролю в объектах природной среды в системе Общегосударственной службы наблюдений и контроля загрязнения природной среды. Головным институтом по разработке и внедрению в практическую деятельность методов определения диоксина в объектах природной среды был назначен ИЭМ НПО «Тайфун».
30 мая 1988 г. НПО «Тайфун» был определен головной организацией по выполнению работ на договорных условиях специальных научно-исследовательских и изыскательских работ в целях обоснования выбора площадок для строительства атомных станций в соответствии с заявками Минатомэнерго.
В начале 2006 г. НПО «Тайфун» было реорганизовано путем присоединения к нему Государственного учреждения «Центральное конструкторское бюро гидрометеорологического приборостроения» (г. Обнинск) с филиалом «Комет» (г. Долгопрудный, Московской области) и Государственного учреждения Региональный центр «Мониторинг Арктики» Росгидромета (г. Санкт-Петербург), получившего после реорганизации наименование Северо-Западный филиал Объединения.